Por la ley N° 1.532 del 16 de octubre de 1884, se crearon los Territorios Nacionales dividiendo los territorios de La Pampa Central y de la Patagonia en los siguientes territorios nacionales: Río Negro, La Pampa, Neuquén, Chubut, Santa Cruz y la Gobernación de la Tierra del Fuego.
Poniéndose fin a la unidad administrativa de la Patagonia argentina el 24 de noviembre de 1884 al asumir los nuevos gobernadores.
Las provincias de Mendoza y de San Luis incorporaron sus territorios meridionales a expensas del Territorio de la Pampa Central.
Se crearon además por división del Territorio Nacional del Gran Chaco los territorios nacionales de Formosa y del Chaco, teniendo éste un territorio que abarcó partes de las actuales provincias de Santa Fe (hasta 1886) y Santiago del Estero (hasta 1910). Se organizó también el Territorio Nacional de Misiones.
La Provincia del Chaco fue creada por la ley Nº 14.037 del 8 de agosto de 1951 y por ley del 20 de diciembre de 1951, pasó a denominarse Provincia Presidente Perón. Esta denominación se dejó sin efecto por decreto-ley N° 4.145 del 17 de octubre de 1955 y se retornó a la anterior.
El 10 de diciembre de 1953 la ley N° 14.294 dispuso la creación de la Provincia de Misiones.
El 7 de abril de 1948 por decreto N° 9.905, se estableció la dependencia política-administrativa del Sector Antártico Argentino del gobernador marítimo del Territorio Nacional de Tierra del Fuego.
La Provincia de La Pampa fue creada por la ley Nº 14.037 del 8 de agosto de 1951, el 20 de diciembre del mismo año su nombre fue cambiado por el de Provincia Eva Perón, hasta que en 1955 después del golpe militar autodenominado Revolución Libertadora se le devolvió la denominación de La Pampa.
El 15 de junio de 1955, durante la presidencia del general Juan Domingo Perón, por ley 14.408 se crearon las provincias siguientes: Provincia de Formosa; Provincia del Neuquén; Provincia de Río Negro; Provincia del Chubut y la Provincia de Patagonia, cuya jurisdicción iba desde el paralelo 46°S hasta el Polo Sur, incluyendo la Gobernación Marítima de Tierra del Fuego, las islas del Atlántico Sur y el Sector Antártico Argentino.
La Zona Militar de Comodoro Rivadavia fue repartida entre las provincias de Patagonia y del Chubut. No llegó a efectivizarse al ser anulada por el gobierno militar que derrocó a Perón.
El decreto-ley Nº 21.178 del 22 de noviembre de 1956 creó el Territorio Nacional de Tierra del Fuego, Antártida e Islas del Atlántico Sur y con el resto de la Provincia de Patagonia se creó la Provincia de Santa Cruz.